Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll4Q80V24 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms