Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup214Q80U93 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms