Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pja2Q80U04 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pja2Q80U04 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms