Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms