Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnf1Q7TSH7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms