Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ckap2lQ7TS74 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms