Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4b1Q7TS58 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms