Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms