Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Raver2Q7TPD6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Raver2Q7TPD6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms