Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp397Q7TNK4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp397Q7TNK4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms