Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nphp3Q7TNH6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nphp3Q7TNH6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms