Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Scn4bQ7M729 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn4bQ7M729 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms