Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snd1Q78PY7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snd1Q78PY7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms