Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps27Q6ZWU9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps27Q6ZWU9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms