Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SpopQ6ZWS8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SpopQ6ZWS8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms