Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RfflQ6ZQM0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RfflQ6ZQM0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms