Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd3Q6ZQK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms