Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nup188Q6ZQH8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup188Q6ZQH8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms