Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms