Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms