Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b3Q6UQ17 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Atp8b3Q6UQ17 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Atp8b3Q6UQ17 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Atp8b3Q6UQ17 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Atp8b3Q6UQ17 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b3Q6UQ17 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms