Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shc4Q6S5L9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms