Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms