Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nudcd1Q6PIP5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms