Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fchsd1Q6PFY1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd1Q6PFY1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms