Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasa4Q6PFQ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasa4Q6PFQ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms