Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmeff1Q6PFE7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms