Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms