Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SvoplQ6PDF3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SvoplQ6PDF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms