Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mfsd13aQ6PDE8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms