Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4aQ6PDC8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms