Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg2aQ6P4T0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms