Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Podnl1Q6P3Y9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms