Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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BckdhbQ6P3A8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhbQ6P3A8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhbQ6P3A8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms