Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Stmnd1Q6P3A1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stmnd1Q6P3A1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms