Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms