Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec23ipQ6NZC7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms