Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Szrd1Q6NXN1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms