Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcd11Q6NS46 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms