Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep78Q6IRU7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms