Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms