Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg9bQ6EBV9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms