Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarca2Q6DIC0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Smarca2Q6DIC0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms