Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rftn1Q6A0D4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms