Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cntn4Q69Z26 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms