Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CilpQ66K08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms