Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgef39Q66JY6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgef39Q66JY6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms