Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VclQ64727 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VclQ64727 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VclQ64727 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VclQ64727 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms