Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sdc3Q64519 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc3Q64519 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms