Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Top2bQ64511 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms